隋文帝勵精圖治，統一南北，開創了一個大一統的王朝。關於他的死亡，至今莫衷一是。

有說法說楊堅是被楊廣害死的。

因為獨孤伽羅不滿太子楊勇的生活態度，又受到楊廣的蒙蔽，便慫恿楊堅廢掉了楊勇的太子地位，立楊廣為太子。楊廣得到了太子寶座之後，為了進一步鞏固太子之位，讓楊素編造罪名，陷害弟弟楊秀，使他也被楊堅廢為庶人。

到了公元604年，楊堅病倒在了仁壽宮，楊廣貪戀皇位，等得有些不耐煩了，就找楊素要主意。

根據《史通》記載，楊廣不放心父親彌留之際會發生什麼變化，秘密派人問楊素內宮父皇的病狀。楊素把老皇帝的病情一五一十寫明，封上信口回送楊廣。送信的宮人轉了幾道手，誤以為是送給皇帝的上奏，呈給了楊堅。病危的楊堅見信後又恨又悔，非常生氣。但當時還沒有廢除太子的意思。

有一次，陳夫人進來之後神色慌張，楊堅就問緣由。陳夫人回答：「太子無禮！」原來是陳美人出去更衣時，差點被楊廣強姦。老皇帝聞言，一口氣上不來差點氣死，大叫：「畜生何足付大事！獨孤皇后誤我！」

就召喚身邊的大臣楊述、元嚴說：「呼我兒來見！」兩人以為是召楊廣，老皇帝忙說：「是楊勇！」

楊素知道這事，馬上告知楊廣事急，又矯詔逮捕楊述和元嚴，命楊廣心腹張衡入侍，禁止宮內一切人員出入，「俄而上崩。」

《史通》中還記載，

「（楊素）令張衡入拉帝，血濺屏風，冤痛之聲聞於外，崩……」

此種記載，類似演義，不可信。

有的史書記載，楊堅知道楊廣的陰謀之後，不動聲色，沒有驚動當時已經有了大勢力的楊廣，而是派人要把流放在外的楊勇招來，要廢掉楊廣的太子身份，傳位給楊勇。

楊廣安排在楊堅身邊的親信趕忙把這個壞消息報告給了楊廣。楊廣先是撤掉了楊堅身邊侍奉的人，都換上自己的親信。後來，乾脆心狠手辣地將自己病中的父親毒死，把剛剛趕到的哥哥楊勇殺死，自己踏著血腥之路坐上了夢寐以求的皇帝寶座。

而唐朝魏徵等人編纂的史書，對於文帝的死亡記載應該是可信的：

「（仁壽）四年春四月乙卯，上不豫……秋七月乙未，日青無光，八日乃復……甲辰，上以疾甚，卧於仁壽宮，與百僚辭訣，並握手獻欷。丁未，崩于大寶殿，時年六十四。」

對於隋朝史事的記載，基本是如實的，如有隋煬帝殺死父親的事情，他們不會給予隱瞞的。老皇帝臨死與百官辭訣，應該是善終，並非為太子楊廣所弒。